Outline

• Main Page
• 1 : Introduction
• 1.1 : Utilisation de bibliothèques
• 1.2 : Ensemble de fonctions CMake
• 1.3 : CMakeLists.txt pricipal du projet
• 2 : La réaction de diffusion de Gray Scott
• 3 : Organisation du projet
• 3.1 : Format de données
• 3.1.1 : Description du format de données
• 3.1.1.1 : Le header MatrixHdf5.h
• 3.1.1.2 : La source MatrixHdf5.cpp
• 3.1.2 : Fonction d'initialisation
• 3.1.2.1 : Le fichier header
• 3.1.2.2 : Le fichier source
• 3.1.2.3 : Le CMakeLists.txt
• 3.2 : Sortie visuelle
• 3.2.1 : Le main.cpp
• 3.2.1.1 : Les includes du programme
• 3.2.1.2 : La fonction qui définie les arguments du programme que l'on attends
• 3.2.1.3 : La fonction de HDF5 aux images PNG
• 3.2.1.4 : La fonction principale
• 3.2.1.5 : Le fichier main.cpp complet
• 3.2.2 : Le CMakeLists.txt
• 4 : Calcul et implémentation
• 4.1 : Implémentation naïve
• 4.1.1 : Bibliothèque de calcul
• 4.1.1.1 : Comment implémenter les accès aux voisins ?
• 4.1.1.2 : Le header naive_propagation.h
• 4.1.1.3 : La source naive_propagation.cpp
• 4.1.1.4 : Le fichier CMakeLists.txt
• 4.1.2 : Évaluation de performances
• 4.1.2.1 : Notre fichier main.cpp
• 4.1.2.1.1 : Les includes
• 4.1.2.1.2 : La fonction d'évaluation de performance
• 4.1.2.1.3 : La fonction principale du programme
• 4.1.2.1.4 : Le fichier complet
• 4.1.2.2 : Le fichier CMakeLists.txt
• 4.1.2.3 : Compilation et tests de performances
• 4.1.2.4 : Résultats des tests de performances
• 4.1.3 : Programme de calcul
• 4.1.3.1 : Le fichier main.cpp
• 4.1.3.1.1 : Les includes
• 4.1.3.1.2 : La définition des arguments du programme
• 4.1.3.1.3 : La fonction générale du programme
• 4.1.3.1.4 : La fonction principale du programme
• 4.1.3.1.5 : Le fichier main.cpp complet
• 4.1.3.2 : Le fichier CMakeLists.txt
• 4.1.3.3 : Compilation
• 4.1.3.4 : Utilisation
• 4.2 : Implémentation vectorizée
• 4.2.1 : Bibliothèque de calcul
• 4.2.1.1 : Le header vectorized_propagation.h
• 4.2.1.2 : La source vectorized_propagation.cpp
• 4.2.1.2.1 : Les includes
• 4.2.1.2.2 : La fonction de calcul vectorisée
• 4.2.1.2.3 : Le fichier source complet
• 4.2.1.3 : Le fichier CMakeLists.txt
• 4.2.2 : Évaluation de performances
• 4.2.2.1 : Notre fichier main_vectorized.cpp
• 4.2.2.1.1 : Les includes
• 4.2.2.1.2 : La fonction d'évaluation de performance
• 4.2.2.1.3 : La fonction principale du programme
• 4.2.2.1.4 : Le fichier complet
• 4.2.2.2 : Le fichier CMakeLists.txt
• 4.2.2.3 : Compilation et tests de performances
• 4.2.2.4 : Résultats des tests de performances
• 4.3 : Implémentation en fonctions intrinsèques
• 4.3.1 : Comment rendre vectorisable notre calcul ?
• 4.3.2 : Bibliothèque de calcul
• 4.3.2.1 : Le header intrinsics_propagation.h
• 4.3.2.2 : La source intrinsics_propagation.cpp
• 4.3.2.2.1 : Les includes
• 4.3.2.2.2 : La fonction de calcul avec des intrinsèques
• 4.3.2.2.3 : Le fichier source complet
• 4.3.2.3 : Le fichier CMakeLists.txt
• 4.3.3 : Évaluation de performances
• 4.3.3.1 : Notre fichier main_intrinsics.cpp
• 4.3.3.1.1 : Les includes
• 4.3.3.1.2 : La fonction d'évaluation de performance
• 4.3.3.1.3 : La fonction principale du programme
• 4.3.3.1.4 : Le fichier complet
• 4.3.3.2 : Le fichier CMakeLists.txt
• 4.3.3.3 : Compilation et tests de performances
• 4.3.3.4 : Résultats des tests de performances
• 4.3.4 : Programme de calcul
• 4.3.4.1 : Le fichier main_intrinsics.cpp
• 4.3.4.1.1 : Les includes
• 4.3.4.1.2 : La définition des arguments du programme
• 4.3.4.1.3 : La fonction générale du programme
• 4.3.4.1.4 : La fonction principale du programme
• 4.3.4.1.5 : Le fichier main_intrinsics.cpp complet
• 4.3.4.2 : Le fichier CMakeLists.txt
• 4.3.4.3 : Compilation
• 4.3.4.4 : Utilisation
• 5 : Une approche plus subtile
• 5.1 : Découpage par blocs
• 5.2 : Approche subtile : performance avec des blocs simples
• 5.2.1 : Bibliothèque de calcul
• 5.2.1.1 : Le header intrinsics_propagation_block.h
• 5.2.1.2 : La source intrinsics_propagation_block.cpp
• 5.2.1.2.1 : Les includes
• 5.2.1.2.2 : La fonction de calcul avec des intrinsèques
• 5.2.1.2.3 : Le fichier source complet
• 5.2.1.3 : Le fichier CMakeLists.txt
• 5.2.2 : Évaluation de performances
• 5.2.2.1 : Notre fichier main_intrinsics_block.cpp
• 5.2.2.1.1 : Les includes
• 5.2.2.1.2 : La fonction d'évaluation de performance
• 5.2.2.1.3 : La fonction principale du programme
• 5.2.2.1.4 : Le fichier complet
• 5.2.2.2 : Le fichier CMakeLists.txt
• 5.2.2.3 : Compilation et tests de performances
• 5.2.2.4 : Performances
• 5.3 : Approche encore plus subtile : performance avec des blocs liés
• 5.3.1 : Bibliothèque de calcul
• 5.3.1.1 : Le header intrinsics_propagation_link_block.h
• 5.3.1.2 : La source intrinsics_propagation_link_block.cpp
• 5.3.1.2.1 : Les includes
• 5.3.1.2.2 : La fonction de calcul avec des intrinsèques pour les blocs
• 5.3.1.2.3 : Le fichier source complet
• 5.3.1.3 : Le fichier CMakeLists.txt
• 5.3.2 : Évaluation de performances
• 5.3.2.1 : Notre fichier main_intrinsics_link_block.cpp
• 5.3.2.1.1 : Les includes
• 5.3.2.1.2 : La fonction d'évaluation de performance
• 5.3.2.1.3 : La fonction principale du programme
• 5.3.2.1.4 : Le fichier complet
• 5.3.2.2 : Le fichier CMakeLists.txt
• 5.3.2.3 : Compilation et tests de performances
• 5.3.2.4 : Performances
• 5.4 : Peformance du programme avec des blocs liés
• 5.4.1 : Programme de calcul
• 5.4.1.1 : Le fichier main_intrinsics_link_block.cpp
• 5.4.1.1.1 : Les includes
• 5.4.1.1.2 : La définition des arguments du programme
• 5.4.1.1.3 : La fonction générale du programme
• 5.4.1.1.4 : La fonction principale du programme
• 5.4.1.1.5 : Le fichier main_intrinsics_link_block.cpp complet
• 5.4.1.2 : Le fichier CMakeLists.txt
• 5.4.1.3 : Compilation
• 5.4.1.4 : Utilisation
• 5.4.2 : Comment se fait-ce ?
• 5.5 : Parallélisation avec des blocs liés
• 5.5.1 : Programme de calcul
• 5.5.1.1 : Le fichier main_intrinsics_link_block_parallel.cpp
• 5.5.1.1.1 : Les includes
• 5.5.1.1.2 : La définition des arguments du programme
• 5.5.1.1.3 : La fonction générale du programme
• 5.5.1.1.4 : La fonction principale du programme
• 5.5.1.1.5 : Le fichier main_intrinsics_link_block_parallel.cpp complet
• 5.5.1.2 : Le fichier CMakeLists.txt
• 5.5.1.3 : Compilation
• 5.5.2 : Performances
• 6 : Conclusion